根據(jù)《意見》，濟寧市深化市委改革，著眼于健全加強黨的全面領(lǐng)導的制度，優(yōu)化市委組織機構(gòu)，建立健全市委對重大工作的領(lǐng)導體制機制，強化黨的組織在同級組織中的領(lǐng)導地位，更好發(fā)揮黨的職能部門作用，推進職責相近的黨政機關(guān)合并設立或合署辦公，從機構(gòu)職能上把加強黨的領(lǐng)導落到各領(lǐng)域各環(huán)節(jié)，提高市委把方向、管大局、作決策、保實力的能力。
在市委機構(gòu)改革中，將組建濟寧市監(jiān)察委員會、市委全面依法治市委員會、市委財經(jīng)委員會、市委審計委員會、市委住房和城鄉(xiāng)建設管理委員會、市委教育工作領(lǐng)導小組、市委網(wǎng)絡安全和信息化委員會辦公室、市委黨史研究院（市地方史志研究院）。
為加強市委對涉及全市重大工作的領(lǐng)導，強化統(tǒng)籌協(xié)調(diào)職責，市委全面深化改革領(lǐng)導小組、市國家安全領(lǐng)導小組、市委網(wǎng)絡安全和信息化領(lǐng)導小組、市委外事工作領(lǐng)導小組、市委農(nóng)村工作領(lǐng)導小組改為委員會。濟寧市委軍民融合發(fā)展委員會作為市委議事協(xié)調(diào)機構(gòu)，辦公室設在市發(fā)展和改革委員會；優(yōu)化濟寧市委辦公室職責，將市檔案館（市檔案局）承擔的行政職能劃入市委辦公室；濟寧市委組織部統(tǒng)一管理市委機構(gòu)編制委員會辦公室、統(tǒng)一管理公務員工作；濟寧市委宣傳部統(tǒng)一領(lǐng)導文化旅游、新聞出版廣電工作；濟寧市委統(tǒng)一戰(zhàn)線工作部統(tǒng)一管理對臺工作、民族宗教、僑務工作。
《意見》同時明確，深化濟寧市政府機構(gòu)改革，堅持轉(zhuǎn)變政府職能，簡政放權(quán)，著力破除制約使市場在資源配置中起決定性作用、更好發(fā)揮政府作用的體制機制弊端，圍繞推動高質(zhì)量發(fā)展、建設現(xiàn)代經(jīng)濟體系，加強和完善政府在經(jīng)濟調(diào)節(jié)、市場監(jiān)管、社會管理、公共服務、生態(tài)環(huán)境保護職能，著力優(yōu)化政府機構(gòu)設置、職能配置，全面提高行政效能，構(gòu)建職責明確、依法行政的政府治理體系，增強政府公信力和執(zhí)行力，加快建設人民滿意的服務型政府。
市政府將組建市工業(yè)和信息化局、市自然資源和規(guī)劃局、生態(tài)環(huán)境局、市農(nóng)業(yè)農(nóng)村局、市文化和旅游局、市衛(wèi)生健康委員會、市退役軍人事務局、市應急管理局、市政府外事辦公室、市市場監(jiān)督管理局、市醫(yī)療保障局、市地方金融監(jiān)督管理局、市行政審批服務局、市城鄉(xiāng)水務局、市能源局、市投資促進局；重新組建濟寧科學技術(shù)局、市司法局；優(yōu)化濟寧市政府辦公室職責、市發(fā)展和改革委員會職責、市住房和城鄉(xiāng)建設局職責、市交通運輸局職責、市商務局職責、市審計局職責；強化濟寧市財政局、市政府國有資產(chǎn)監(jiān)督管理委員會職責；改革國稅地稅征管體制。
與此同時，《意見》還指出深化濟寧市市人大、市政協(xié)機構(gòu)改革。發(fā)揮人才及其常委會在立法工作中的主導作用，健全人大組織制度和工作制度，完善人大專門委員會設置。組建市人大社會建設委員會，整合市人大內(nèi)務司法委員會、財政經(jīng)濟委員會、教育科學文化衛(wèi)生委員會的相關(guān)職責；市人大內(nèi)務司法委員會更名為市人大監(jiān)察和司法委員會，增加國家監(jiān)察體制改革等職責。推進人民政協(xié)履職能力建設，加強人民政協(xié)民主監(jiān)督，優(yōu)化政協(xié)專門委員會設置。組建市政協(xié)農(nóng)業(yè)和農(nóng)村委員會，將市政協(xié)經(jīng)濟和農(nóng)業(yè)農(nóng)村委員會聯(lián)系農(nóng)業(yè)界、研究“三農(nóng)”問題等職責調(diào)整到市政協(xié)農(nóng)業(yè)和農(nóng)村委員會。
深化市級群團組織改革，抓好市總工會、團市委、市婦聯(lián)、市科協(xié)、市文聯(lián)、市僑聯(lián)等群團機關(guān)改革方案的落實，將市紅十字會機關(guān)、市殘聯(lián)機關(guān)等明確為群團機關(guān)。深化市級綜合行政執(zhí)法體制改革，減少執(zhí)法層級，積極推動執(zhí)法力量下沉，除上級明確規(guī)定可以實行市區(qū)兩級執(zhí)法的領(lǐng)域外，市與任城區(qū)原則上只保留一個執(zhí)法層級，以區(qū)級執(zhí)法為主的，市級主要負責指導、監(jiān)督和辦理重大復雜跨區(qū)域案件；以市級執(zhí)法為主的，區(qū)級不再設執(zhí)法隊伍。
濟寧市將穩(wěn)妥有序推進市級機構(gòu)改革。全面貫徹“先立后破、不立不破”原則，有組織、有紀律、有步驟推進機構(gòu)改革，有序做好轉(zhuǎn)隸、掛牌、集中辦公等工作，確保思想不亂、工作不斷、隊伍不散、干勁不減。2018年12月底前完成新組建部門領(lǐng)導班子配備、掛牌工作，2019年1月底前完成人員轉(zhuǎn)隸工作，2019年2月底前按程序印發(fā)市級涉改部門“三定”規(guī)定，2019年3月底前完成市級機構(gòu)改革。與市級機構(gòu)改革相銜接，統(tǒng)籌做好縣（市、區(qū)）機構(gòu)改革工作，細化措施，加強指導，確保2019年3月底前完成機構(gòu)改革工作。
中共濟寧市委設置紀檢監(jiān)察機關(guān)1個，計入機構(gòu)限額的工作機關(guān)11個（設在相關(guān)部門的市委議事協(xié)調(diào)機構(gòu)的辦事機構(gòu)不計入機構(gòu)限額）。其中，紀律檢查委員會與監(jiān)察委員會合署辦公，實行一套工作機構(gòu)、兩個機關(guān)名稱；辦公室掛市檔案局、保密委員會辦公室（市國家保密局）牌子；組織部掛市公務員局牌子；宣傳部掛市政府新聞辦公室、市精神文明建設委員會辦公室牌子；統(tǒng)一戰(zhàn)線工作部掛市政府臺灣事務辦公室、市民族宗教事務局、市政府僑務辦公室牌子；網(wǎng)絡安全和信息化委員會辦公室掛互聯(lián)網(wǎng)信息辦公室牌子。教育工作委員會與市教育局合署辦公，不計入機構(gòu)限額。
濟寧市人民政府設置工作部門35個。其中，辦公室掛研究室、大數(shù)據(jù)局、口岸辦公室牌子；發(fā)展和改革委員會掛新舊動能轉(zhuǎn)換綜合試驗區(qū)建設辦公室、糧食和物資儲備局牌子；科學技術(shù)局掛濟寧農(nóng)業(yè)科技園區(qū)建設辦公室、外國專家局牌子；自然資源和規(guī)劃局掛林業(yè)局牌子；城鄉(xiāng)水務局掛南水北調(diào)工程建設管理局牌子；農(nóng)業(yè)農(nóng)村局掛扶貧開發(fā)辦公室、畜牧獸醫(yī)局牌子；文化和旅游局掛新聞出版廣電局、文物局牌子；衛(wèi)生健康委員會掛中醫(yī)管理局牌子；行政審批服務局掛政務服務管理辦公室牌子；地方金融監(jiān)督管理局掛金融工作辦公室牌子。（呂光社 張譽耀）（完）
